相似度超过97%的,就可以认为是一个物种。 相似度低于97%的,就可以认为是不同物种,进行下一阶段检测。 不过就是这样一种不太精细的检测手段,却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎: 大部分样本在经过检测之后,都会发现相似度在99.99%以上,与其他某某微生物是同一物种。 总而言之。 这项技术在定属方面还是靠谱的。 又过了一会儿。 裘生一脸惊喜的抬起头,声音骤然拔高了几分: “老徐,相似度46.9%,46.9%!!” “毫无疑问,这是一类新物!” 徐云认真的看了他一眼,确认道: “只有一种新物吗?” “没错,只有一种!” 徐云若有所思的点点头,又道: “那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。” 众所周知。 新物鉴定一般都有九个流程: 1、16s相似度。 2、形态学观察。 比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等,还包括最适生长条件的确定。 3、磷脂脂肪酸鉴定,这个具有属特异性。 4、呼吸醌,也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种,这个有种特异性。 5、分子杂交,也就是测定基因组序列,草图就行,然后跟近源物种去比较。 相似度超过70%是一个种,低于70%是不同物种。 6、碳源利用情况,看一下能利用哪些碳源,一共有95种碳源的测试。 7、api试剂盒鉴定,生理生化鉴定的一方面。 8、gc含量。 9、革兰氏染色。 大概经过这些方面的检查,就可以确定是不是新种了。(注:不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看?这种详细流程应该没有其他书写过,找人问其实很麻烦的,要是还被嫌水下次我就不写了) 其中第五个流程,也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部 测出来的46.9%实在是差距太明显了。 考虑到时间问题,徐云将几个步骤逐一分工,由几位工具人……咳咳,课题组成员同步进行。 五个小时后。 一道最终报告出炉了。 “节丛孢属的一类全新微生物,1000倍油镜下可观察到形态,体外具备大量假丝。” “这种假丝可以分离,与目标结合完成某种化合反应,这是……秃头攻击?” “一片青苔中可以高密度富集8000单位的极少量新物,特性上与嗜酸乳杆菌有一定类似……嗯?” 随后看着其中的一栏报告,徐云有些疑惑的抬起头,对裘生问道: “老裘,新物对食物残渣的净化效果最为明显?” 裘生点了点头,指着不远处的一个培养皿道: “经过我们的初步检测,这种新型微生物可以有效遏制残渣中氨气、有机酸和硫化物的生成。” “并且对奈瑟氏菌和厌氧链球菌之类的细菌,有着极强的杀伤力。” 徐云微微一愣: “奈瑟氏菌和厌氧链球菌?” 不过很快,他便反应了过来: 这两种细菌,都是人体唾液和牙龈的标准分泌物之一: 每一毫升的普通唾液里可以寻找出奈瑟氏菌8000万个,在每一克牙龈分泌物中更是可以寻找出10亿个厌氧链球菌。 在食堂里吐出骨头啦、吐出西红柿皮啦、吐出半截蛆虫时沾染上这些细菌,最后流入下水管道是很正常的事情。 接着徐云指着报告,对裘生说道: “老裘,新种只对食物残渣和唾液细菌有效吗?”M.bOwUChiNA.COM